Converter STK para PIV

Entendendo os formatos de arquivo stk e piv

STK files são pilhas de imagens comumente produzidas pelo MetaMorph, um software usado para aquisição e análise de imagens de microscopia. Esses arquivos geralmente armazenam uma sequência de imagens (como dados de time-lapse ou z-stack) em um formato proprietário, frequentemente usado em pesquisa biológica.

PIV files estão associados ao software Particle Image Velocimetry (PIV), que analisa o fluxo de fluidos rastreando o movimento de partículas entre pares de imagens. O formato PIV é usado para armazenar dados de imagens brutas ou campos de vetores de velocidade processados, dependendo do software.

Por que converter stk para piv?

Converter STK para PIV é necessário quando você deseja analisar sequências de imagens de microscopia com o software PIV para estudar a dinâmica do fluxo ou o movimento de partículas. Como as ferramentas PIV frequentemente exigem formatos de entrada específicos, a conversão garante compatibilidade e análise precisa.

Como converter stk para piv

A conversão direta de STK para PIV nem sempre é simples, pois os formatos atendem a propósitos diferentes. O fluxo de trabalho típico envolve extrair quadros de imagem da pilha STK e depois importá-los para o software de análise PIV.

1. Extrair imagens do STK: Use ImageJ/Fiji, uma ferramenta de análise de imagens gratuita e poderosa, para abrir arquivos STK e exportar a sequência de imagens.
   File → Importar → Sequence de Imagens (se necessário), então File → Save as → TIFF ou outro formato suportado.
2. Importar imagens para o software PIV: Abra sua ferramenta de análise PIV (como PIVlab para MATLAB ou OpenPIV), e carregue a sequência de imagens exportada. Essas ferramentas normalmente aceitam formatos de imagem padrão (TIFF, PNG, BMP) para análise.
3. Salvar ou exportar como PIV: Após a análise, o software permitirá salvar os resultados no formato PIV nativo.

Software recomendado para conversão de stk para piv

• ImageJ/Fiji: Melhor para extrair imagens de arquivos STK. Gratuito e amplamente usado em imagens científicas.
• PIVlab (ferramenta MATLAB): Popular para análise PIV e suporta vários formatos de imagem.
• OpenPIV: Ferramenta de código aberto para análise PIV compatível com formatos padrão de imagem.

Resumo

Para converter STK para PIV, extraia os quadros de imagem do arquivo STK usando ImageJ/Fiji e depois importe-os para o software de análise PIV como PIVlab ou OpenPIV. Esse fluxo de trabalho garante compatibilidade e análise de fluxo precisa.