Conversor online gratuito de LIF para JPG

Softwares de microscopia e visualizadores de imagens podem não abrir arquivos Leica .lif, enquanto JPG é aceito por editores, navegadores, relatórios e ferramentas de mensagens comuns. A conversão também é útil quando um LIF contém uma imagem que precisa ser compartilhada sem o software de microscopia original.

O que é o formato LIF

LIF é um formato de arquivo de imagem Leica usado pelos sistemas e softwares de aquisição de imagens da Leica Microsystems, como o Leica LAS X e conjuntos de aplicativos Leica mais antigos. Normalmente, ele armazena dados de microscopia como um contêiner com várias séries de imagens, z-stacks, pontos temporais, canais e metadados de aquisição, em vez de uma única imagem plana.

Portanto, um único arquivo LIF pode conter várias imagens em diferentes resoluções ou configurações de microscópio. A abertura do arquivo pode exigir um software compatível com dados Leica por meio da biblioteca Bio-Formats.

O que é o formato JPG

JPG, também chamado de JPEG, é um formato de imagem raster amplamente compatível com páginas da web, documentos de escritório, apresentações, email e edição de imagens de uso geral. Ele produz arquivos menores do que TIFF não compactado ou muitos formatos nativos de microscopia, utilizando compressão com perdas.

JPG representa uma imagem bidimensional renderizada. Ele não preserva a estrutura completa de séries de um arquivo LIF, o z-stack, a dimensão temporal, os dados dos canais, os metadados de aquisição nem as informações de medição científica.

Como converter LIF em JPG de fato

Usando Fiji ou ImageJ

1. Instale o Fiji, que inclui o ImageJ e o importador Bio-Formats.
2. Abra o arquivo por meio de File → Open ou escolha Plugins → Bio-Formats → Bio-Formats Importer e selecione o arquivo .lif.
3. Na caixa de diálogo do Bio-Formats, selecione a série de imagens necessária. Desative Split channels, a menos que sejam necessárias imagens de canais separados, e ative uma visualização composta quando os canais precisarem ser renderizados juntos.
4. Selecione o z-slice e o ponto temporal necessários. Um JPG não pode conter o conjunto de dados multidimensional completo.
5. Escolha File → Save As → Jpeg, selecione um nome de arquivo terminado em .jpg, defina a qualidade JPEG, se essa opção for oferecida, e salve.

Para um stack ou uma série temporal, exporte os slices ou frames necessários individualmente em vez de salvar apenas o plano exibido atualmente. O Fiji também pode criar uma sequência de imagens animada ou numerada, mas cada JPG continua sendo uma imagem plana separada.

Usando software Leica

No Leica LAS X, abra o arquivo LIF, selecione a série necessária e as configurações de exibição e use o comando de exportação do aplicativo, normalmente File → Export ou File → Save As, escolhendo JPEG. Os nomes dos menus variam entre as versões do LAS X. Exporte a visualização renderizada depois de selecionar a composição dos canais, o brilho, o contraste, a escala e a resolução.

Usando 101convert.com

Para uma conversão simples sem instalar software, faça upload do arquivo LIF para o 101convert.com, escolha JPG como formato de saída, inicie a conversão e baixe o arquivo resultante. Isso é adequado quando a saída necessária é uma única imagem renderizada e não são necessários controles detalhados de microscopia.

Limitações de qualidade e compatibilidade

Escolha a série de imagens, a visualização dos canais, o slice e os ajustes de exibição antes de exportar; essas escolhas determinam o que aparecerá no JPG. Um LIF pode conter dados de intensidade de 16 bits ou de ponto flutuante, mas o JPG normalmente armazena uma imagem colorida de 8 bits, portanto as informações quantitativas de intensidade podem ser recortadas ou alteradas.

Use a maior resolução de exportação disponível e uma configuração alta de qualidade JPEG para relatórios ou rascunhos de publicações. Para arquivamento científico, análise quantitativa ou reprocessamento posterior, mantenha o LIF original e considere exportar para TIFF; o JPG não é adequado como única cópia de arquivo porque descarta a estrutura de microscopia e introduz artefatos de compressão.