Conversor online gratuito de NDPI para JPG

O que é o formato NDPI

NDPI é um formato proprietário de imagem de lâmina inteira criado principalmente pelos scanners Hamamatsu NanoZoomer. Ele pode conter imagens microscópicas extremamente grandes e multirresolução usadas em patologia digital, pesquisa e arquivamento de lâminas.

Você pode encontrar arquivos NDPI no software Hamamatsu NDP.view2, no QuPath, no Fiji/ImageJ com Bio-Formats e em aplicativos desenvolvidos com base na biblioteca OpenSlide. Um arquivo NDPI pode ter muitos gigabytes e incluir vários níveis de resolução, portanto não é equivalente a uma fotografia comum de uma única camada.

O que é o formato JPG

JPG, também chamado de JPEG, é um formato de imagem raster amplamente compatível que utiliza compressão com perdas. Ele é adequado para prévias de lâminas, relatórios, apresentações, sites, anexos de e-mail e edição geral de imagens.

Os arquivos JPG normalmente são muito menores que os arquivos NDPI e podem ser abertos sem softwares especializados de microscopia. O formato não preserva a pirâmide NDPI, os metadados específicos do scanner, as anotações, os vários planos focais nem os dados de imagem para diagnóstico.

Como converter NDPI para JPG de fato

Use o conversor online

Você pode converter o arquivo em 101convert.com gratuitamente, sem instalar software. Envie o arquivo .ndpi, escolha JPG como formato de saída, inicie a conversão e baixe a imagem resultante. Para lâminas muito grandes, use um método para desktop ou exporte uma região menor, pois um JPG em resolução total pode ultrapassar os limites de memória ou tamanho de arquivo.

Exporte uma prévia da lâmina com OpenSlide e Python

OpenSlide foi projetado para ler formatos de lâmina inteira, incluindo muitos arquivos NDPI. Instale a biblioteca de sistema OpenSlide para o seu sistema operacional e, em seguida, instale os bindings do Python e o Pillow:

pip install openslide-python pillow

Salve isto como ndpi_to_jpg.py e substitua o nome do arquivo de entrada:

import openslide

slide = openslide.OpenSlide("sample.ndpi")
image = slide.get_thumbnail((6000, 6000)).convert("RGB")
image.save("sample.jpg", "JPEG", quality=90, optimize=True)

Execute com:

python ndpi_to_jpg.py

get_thumbnail() cria uma prévia da lâmina inteira limitada a 6000 por 6000 pixels. Aumente essas dimensões para obter mais detalhes, mas verifique a memória disponível antes de exportar imagens muito grandes.

Exporte uma região selecionada em alta resolução

Para uma área de tecido que precise manter mais detalhes, leia uma região em um nível de pirâmide escolhido em vez de converter a lâmina inteira:

import openslide

slide = openslide.OpenSlide("sample.ndpi")
region = slide.read_region((10000, 15000), 0, (4000, 3000)).convert("RGB")
region.save("region.jpg", "JPEG", quality=95)

As coordenadas são medidas a partir do canto superior esquerdo no nível 0, geralmente a resolução mais alta disponível. Altere a localização e as dimensões para corresponder à área de tecido necessária. As coordenadas do nível 0 e os níveis disponíveis podem ser consultados com slide.level_dimensions.

Use o QuPath ou o Fiji

O QuPath pode abrir arquivos NDPI compatíveis por meio do OpenSlide. Abra a lâmina, selecione a visualização ou região necessária e use File → Export images para exportar um JPG. No Fiji/ImageJ, abra o arquivo por meio de File → Open Samples ou do importador Bio-Formats e use File → Save As → JPEG. Os nomes dos menus podem variar conforme a versão do aplicativo e os plugins instalados.

Qualidade, compatibilidade e limitações

A exportação para JPG envolve perdas. Use um valor de qualidade entre 90–95 para uso geral e evite abrir e salvar novamente o mesmo JPG várias vezes. PNG ou TIFF é preferível quando são necessárias análise em nível de pixel, anotações ou preservação sem perdas.

Um JPG da lâmina inteira ainda pode ser grande demais para alguns visualizadores, mesmo após a compressão. Exportar uma miniatura ou uma região geralmente oferece mais compatibilidade do que transformar a lâmina inteira em uma única imagem na resolução máxima.

Não use um JPG como substituto arquivístico ou diagnóstico da fonte NDPI. Ele descarta a estrutura multirresolução e pode introduzir artefatos de compressão que afetam detalhes celulares finos. Mantenha o NDPI original e trate o JPG como uma cópia para apresentação ou compartilhamento.